в ответ на предложение Мнемента :
это должно сделать работу
jps -l | grep org.example.MyMain | cut -d ' ' -f 1 | xargs -rn1 kill
jps -l
: перечислить процесс Java с «полным именем пакета для основного класса приложения или полным путем к файлу JAR приложения».
grep
: выберите понравившийся вам процесс
cut -d -' ' -f 1
: разделить вывод в столбцах, используя разделитель '', и вывести только первый (pid)
xargs -rn1 kill
: выполнить kill для каждого PID (если есть)
обратите внимание, что вы должны запускать jps и xargs с тем же пользователем (или root), с которым вы запускаете процесс