В качестве альтернативы вы можете установить это программно, например, в методе инициализации вашего WorkbenchAdvisor.
PrefUtil.getAPIPreferenceStore().setValue(
IWorkbenchPreferenceConstants.SHOW_INTRO, true);
PrefUtil.saveAPIPrefs();
Но поскольку PrefUtil является внутренним классом, это рекомендуется только в том случае, если вы не можете установить это свойство в своем XML (например, у вас есть вступление, которое не основано на стандартной странице вступления)
PS: проблема, с которой вы столкнулись, заключается в том, что при появлении вступления свойство предпочтения, заданное вами через plugin.customization, устанавливается в значение false, а plugin_customization устанавливает только значения по умолчанию для хранилища предпочтений, как только любой компонент устанавливает это значение значение по умолчанию становится устаревшим. С этим двухслойным режимом вы устанавливаете для этого ключа предпочтения значение true при каждом запуске, и вступление появится.