Это зависит от источника, но если он использует функции и библиотеки linux, установка Linux может оказаться проще, чем заставить его скомпилировать в Windows.
Cygwin является одним из вариантов. MinGW - это еще один вариант.
Сколько кода мы говорим, и какие библиотеки, похоже, он использует?