Netbeans не создает ZF-проекты. Итак, сначала вам нужно создать проект ZF самостоятельно, используя Zend_Tool, а затем в NetBeans создать новый проект (Файл-> Новый проект) и выбрать категорию PHP с «Приложением PHP с существующими источниками» и, конечно же, указать на свой новый проект ZF.