Очевидно, вы не объявляли идентификаторы "exam", "exam1", "exam2" и "exam3".
Эта строка:
void read_file_in_array(int exam[100][3]);
объявляет идентификатор read_file_in_array, но не экзамен.
Вы должны сообщить своему компилятору, что такое экзамен, и не только. Объявление этого может привести к компиляции Вашего файла, но этого недостаточно для работы программы. Вы должны на самом деле определить это. Определение также является декларацией, поэтому его определение поможет. экзамен используется в области main, поэтому я думаю, что вы можете определить экзамен как локальную переменную в main. Попробуйте это
int main()
{
int go,go2,go3;
int exam[100][3];
int exam1[100];
int exam2[100];
int exam3[100];
go=read_file_in_array(exam);
go2=calculate_total(exam1,exam2,exam3);
//go3=display_totals();
cout << go,go2,go3;
return 0;
}/*