Вы можете писать приложения AIR, которые подключаются к вашему PHP, я использую coldfusion и java, поэтому не совсем уверен, какие будут различия, но их не должно быть на стороне сервера.
Для приложения AIR потребуется доступ или скомпилированный файл services-config.xml и три файла, которые он включает. Для моих приложений AIR казалось, что «include» в файле servies-config.xml не работает, и мне пришлось скопировать содержимое этих трех файлов в основной файл.
В строке компиляции вам потребуется что-то вроде:
-services "C: \ Blazeds \ tomcat \ webapps \ chat \ WEB-INF \ flex \ services-config.xml"
(извините, я разрабатываю на машине с Windows), но вам потребуется полный путь к вашему файлу services-config.xml. Эта строка в моих Дополнительных Аргументах Компилятора с моей опцией локали.
Для этого также необходимо создать проект с опцией на стороне сервера.
Возможно, вы захотите также переместить код в отдельный проект, а затем использовать и ваш AIR, и веб-приложение для использования этого третьего проекта с кодом. Тогда одно изменение в коде может повлиять на обе версии, что, конечно, означает, что все придется перекомпилировать.
PS. Я считаю, что программирование Adobe AIR Unleashed - хорошая книга для этой информации.