Я сам нашел проблему. У меня есть все библиотеки в папке lib, и я добавил их в путь к классам проекта. Поскольку сборка копирует все содержимое проекта, моя библиотека также копирует, хотя я снял флажок пакета для библиотеки.
Итак, не помещайте библиотеку в папку lib, если вы хотите исключить ее из встроенной WAR.
Спасибо
Santhosh