Из Выбор средства развертывания установщика Windows , похоже, что создатель встроенного установщика Windows по сути устарел («Будущие версии Visual Studio не будут включать шаблоны проектов установщика Visual Studio».)
На этой странице также рекомендуются InstallShieldLE и Инструментарий Windows Installer XML . Я только что использовал InstallShieldLE, чтобы создать установку, включающую несколько исполняемых файлов, и она, кажется, сработала (я отредактирую это, если окажется, что она не сработала).
Для очень сложных установок, я использовал NSIS в прошлом с большим успехом - я не уверен, сколько дополнительных усилий требует NSIS по сравнению с InstallShieldLE для простых установок.