Стандартный LaTeX действительно любит EPS, но есть причина & mdash; это векторный формат. Правильное создание вашей графики в EPS гарантирует, что качество вашей печатной продукции ограничено только качеством вашего принтера, а не разрешением файла изображения (как будет в случае с растеризованными форматами, такими как JPEG и PNG).
Итак, если вы включите, например, рисование линий, гистограммы и т. д., в значительной степени вам придется делать это в EPS (или PDF), а затем конвертировать в PNG для Интернета. Если ваша графика по сути растеризована (например, вы хотите включить фотографию), вы можете выбрать высококачественный JPEG, а затем использовать jpeg2ps для создания файла EPS для LaTeX (или включить их непосредственно в pdfLaTeX).
Напомним: ваш образ, а не программа определяет правильный формат изображения.
P.S. Такие инструменты, как TeX4ht обычно обрабатывают преобразование изображения, если это необходимо.