Обновили ли вы одну из сборок в своем проекте с момента последнего запуска этого приложения для вас? Похоже, что NHibernate был построен против версии 1.0.0.3, и у вас в настоящее время 1.0.1.0.
Вы должны иметь возможность использовать элемент BindingRedirect в вашем App.config (или, при необходимости, web.config), чтобы указать .Net Framework для удовлетворения зависимости с другой версией. Что-то вроде
<configuration>
<runtime>
<assemblyBinding xmlns="urn:schemas-microsoft-com:asm.v1">
<dependentAssembly>
<assemblyIdentity name="Iesi.Collections"
publicKeyToken="aa95f207798dfdb4"
culture="neutral" />
<bindingRedirect oldVersion="1.0.0.3"
newVersion="1.0.1.0"/>
</dependentAssembly>
</assemblyBinding>
</runtime>
</configuration>