скачать sed для windows из GNU . (Ссылка, которую Кенни дала, датирована). Это всего лишь один исполняемый файл и он маленький (и вы можете взять его с собой на флэшку)
c:\test> sed -i.bak "s/,/./g" *.dat
-i.bak
просто скажите sed сделать резервную копию вашего исходного файла, и модификатор "g" говорит заменить все запятые
Если вы не хотите загружать файлы, вы можете использовать vbscript
Set objFS=CreateObject("Scripting.FileSystemObject")
strFile = "c:\test\file"
Set objFile = objFS.OpenTextFile(strFile)
Do Until objFile.AtEndOfLine
strLine = objFile.ReadLine
strLine = Replace(strline,",",".")
WScript.Echo strLine
Loop
objFile.Close
сохранить как myscript.vbs и в командной строке
c:\test> cscript //nologo myscript.vbs > newfile