Веб-сервисы SP - это сервисы asmx, которые используют http.
Если вы создаете свои собственные службы WCF, вы можете использовать привязку netTCP и повысить производительность.
Однако прирост производительности, который вы получите, вероятно, будет относительно небольшим. Вы также получаете дополнительную работу по созданию служб WCF и риск ошибок в службах, которые вы пишете.
Я бы просто использовал стандартные веб-сервисы SP, если у вас нет особой ситуации / требования.