Вам необходимо переименовать файл, содержащий контроллер, а также имя самого класса контроллера в файле. Насколько я знаю, автоматического способа сделать это не существует, хотя, если у вас много контроллеров для переименования, возможно, стоит потратить время на написание специального сценария, который сделает это за вас.
Как обсуждалось в группе pylons-обсудить , было бы неплохо, если бы класс в файле контроллера был универсальным, поэтому его также не нужно было менять:
controllers/__init__.py
controllers/foo.py:
class Controller...
controllers/bar.py:
class Controller...