Запуск BLAST через XGrid

Question

Есть ли у кого-нибудь опыт работы с BLAST с XGrid?

Поиск в Google показывает, что существует инструмент под названием Xgrid BLAST, но его нет.

Answer 1

BLAST включен в Xgrid.Цитата из " Использование локальной сетки компьютеров под управлением Mac OS X с использованием Xgrid ":

Xgrid включает в себя мощный настраиваемый универсальный интерфейс отправки заданий и Xgrid BLAST- полнофункциональное приложение с поддержкой сетки, основанное на технологии Xgrid, которое запускает экземпляры инструмента поиска локального выравнивания NCBI BLAST.

После установки Xgrid вы можете открыть /Applications/Xgrid BLAST.app на любом клиентекомпьютер.

Для получения дополнительной информации см .:

• документация по установке Xgrid Университетом Юты.
• Как использовать Applexgrid для выполнения заданий BLAST от группы поддержки исследований NACS
• основы Xgrid от лаборатории Blaxter в Институте эволюционной биологии Университета Эдинбурга.Он включает в себя пример Perl-файла для отправки заданий BLAST в Xgrid.

Заключительный совет: если у вас есть какие-либо вопросы, связанные с биоинформатикой на будущее, существует клон StackOverflow, специально предназначенный дляБиоинформатики называют BioStars .Вы можете получить более быстрый ответ там.