Если вы выполните следующее, с вами все будет в порядке.
1) Сначала перейдите по символической ссылке:
[jfv@localhost ~]$ cd myproject
2) Теперь выполните следующую команду:
[jfv@localhost myproject]$ cd -P ./
3) Теперь вы можете проверить свое местоположение и увидите, что находитесь в физическом каталоге
[jfv@localhost myproject]$ pwd
Вывод будет следующим:
/usr/local/projects/myproject
Сейчасвсе, что вы делаете, будет локальным, а не по символической ссылке.