Из того, что я знаю, вы не можете использовать относительные ярлыки в Windows. Можно спросить, зачем нужен ярлык? Почему бы просто не использовать исполняемый файл, который я имею в виду? :)
Вы всегда можете создать .bat-скрипт для запуска вашего приложения. Тем не менее, я не знаю, что вы хотите сделать, поэтому я просто выкидываю идеи.
Редактировать: если .bat не подходит, вы всегда можете создать новое приложение в проекте, которое само по себе действует как ярлык.