В качестве пользователя root введите следующую команду:
apt-get update && apt-get update
Это обновит ваши репозитории, а затем обновит все части программного обеспечения в вашей системе. Пока PHP 5.2.3 находится в ваших настроенных репозиториях, он должен обновляться.
Если у вас нет репозитория с PHP 5.3.2, вы можете добавить тот, который включает это в: http://www.dotdeb.org/instructions/