Не отнимать ничего от супер-крутого ответа Джо, но я должен отметить, что это также возможно из командной строки.
C:\Temp>tf folderdiff /?
TF - Team Foundation Version Control Tool
Copyright (c) Microsoft Corporation. All rights reserved.
Displays a visual representation of the differences between files in two server
folders, in a server folder and a local folder, or in two local folders.
tf folderdiff [sourcePath] targetPath [/recursive] [/noprompt]
[/server:serverName:port] [/filter:filter]
[/filterLocalPathsOnly]
[/view:same,different,sourceOnly,targetOnly]
Pass / noprompt (aka / i) для печати текстового дисплея на консоли или перенаправления его в файл. Например:
tf folderdiff . /r /i > diffs.txt