Вы можете изменить Id меры с помощью XMLA.
В Management Studio щелкните правой кнопкой мыши на одном из двух оригинальных кубов> Сценарий как> Изменить
Найдите меру, которую вы хотите изменить, и измените узел <Measure><Id>
на другой Id.
Выполните XMLA, а затем перейдите к объединению двух кубов. Это должно работать.