Вы можете написать командный файл с помощью этих команд:
start c:\myfolder1
start c:\myfolder2
start c:\myfolder3
start c:\myfolder4
или, поскольку Барт сказал в комментариях к этому ответу, он использует этот метод:
explorer c:\myfolder1 (etc...)
и затем запустите его любым удобным для вас способом (при запуске, через ярлык ...)
Что касается сохранения их позиции на экране, я мало что знаю об этом, но вы можете попробовать использовать Winsplit Revolution . Это позволит вам использовать горячие клавиши для изменения положения окон (Ctrl + Alt + Numpad 7 перемещает окно в верхний левый угол).