Независимо от того, какого провайдера JPA вы используете, я подозреваю, что он настроен на создание и экспорт объектов базы данных, соответствующих вашим сопоставлениям ... и те, которые уже существуют.
В зависимости от вашей конфигурации, на провайдере JPA, на точном сообщении (EclipseLink регистрирует такие сообщения, как предупреждение AFAIK), это может быть просто нормальным явлением или «ошибкой конфигурации».
Если вы хотите получить более подробную информацию, сообщите нам, каким провайдером вы пользуетесь, и покажите свой persistence.xml
.
Обновление: Как подозревается, вы используете EclipseLink, и эти сообщения являются "нормальными" (они регистрируются как предупреждение, если вы внимательно посмотрите на сообщение IIRC)