Скорее всего, Eclipse не смог выяснить в этом новом проекте: где находится исходная папка, где находятся тестовые исходные файлы и т.д. проект (он не был зафиксирован или вы его не проверили).
Например, чтобы получать уведомления об автозаполнении и синтаксических ошибках, Eclipse должен распознавать ваши файлы Java как исходные файлы. В свойствах проекта-> Java Build Path-> Source убедитесь, что ваша исходная папка присутствует.