Вот официальные документы о затмении о том, как это сделать
Дамп этих документов:
Запуск приложения форматирования так же прост, как запуск приложения org.eclipse.jdt.core.JavaCodeFormatter из командной строки:
eclipse -vm <path to virtual machine> -application org.eclipse.jdt.core.JavaCodeFormatter [ OPTIONS ] <files>
При вызове в MacOS пути, указывающие на файл конфигурации или исходные файлы, могут быть относительными, но они будут вычислены из расположения файла eclipse.ini. Это ограничение запуска Eclipse на MacOS. На всех других платформах относительные пути вычисляются относительно текущего пользовательского каталога.
Исходные файлы и / или каталоги Java для форматирования. В указанном каталоге будут отформатированы только файлы, заканчивающиеся на .java.
-config
Использовать стиль форматирования из указанного файла свойств. Подробнее см. В разделе «Создание файла конфигурации для приложения форматирования».
-помощь
Показать справочное сообщение.
-quiet
Печатать только сообщения об ошибках.
-verbose
Будьте многословны с заданием форматирования.