Зависит от сервера. Некоторые поддерживают потоковую передачу мультимедиа, например Red5 .
Я не особо их использовал, но большую часть времени это доставляет хлопоты. Если вы хотите переместить сам файл, лучше всего сделать это с самим файлом, с вашей программой PHP.
Вы также можете использовать другие инструменты, например scp или rsync, если вы не против использования внешних инструментов (это, конечно, зависит от вашей ОС.