У меня одинаковая проблема как в Galileo, так и в Helios и 64-битной Windows 7, и я пока не нашел решения (добавление «/» или удаление «/» в конце URL-адресов сайтов обновлений не работает).
В Helios, по крайней мере, я обнаружил, что использование "Eclipse Marketplace" для обновлений / надстроек работает.