Вы можете попытаться заменить window.setTimeout своей собственной функцией, например
window.setTimeout = function(func, timeout) {
func();
}
, которая может работать или не работать вообще.Кроме того, единственным вариантом будет изменить исходный код (который, как вы сказали, вы не можете сделать)
Имейте в виду, что изменение собственных функций, как это, не совсем оптимальный подход.