Вы можете применить преобразование вращения к UIPageControl.
pageControl.transform = CGAffineTransformMakeRotation(M_PI_2);
Swift 3.0
let angle = CGFloat(M_PI_2)
pageControl.transform = CGAffineTransform(rotationAngle: angle)
Swift 4.0
let angle = CGFloat.pi/2
pageControl.transform = CGAffineTransform(rotationAngle: angle)