Существуют API Audio Session для настройки некоторых SoundProcessing (включая эхоподавление). Однако во время телефонного звонка на стандартном устройстве с ОС iOS аудиосеанс передается приложению Phone, и, таким образом, все возможности управления аудио- и аудиозаписью отнимаются у вашего приложения, вы не можете контролировать его.