Основы DICOM для объемных данных

Question

Я посмотрел на некоторые из стандартов DICOM и страницу Википедии (и все темы DICOM по SO), но, не углубляясь в структуру файла doc (тьфу), я растерялся, что точно хранится в файле DICOM для сканирования, содержащего данные 3D / 4D / 5D.Мне нужен только обзор.

Давайте возьмем МРТ в качестве примера.Содержит ли файл DICOM

1. набор необработанных 2D-изображений, взятых с разных углов
2. стопку срезов, образующих набор данных 3D-вокселей
3. полный набор данных 3D

Другими словами, включает ли DICOM любую постобработку необработанных изображений, снятых устройством обработки изображений?

Что касается 4D, предположительно, это простоколлекция из нескольких 3D-наборов данных, каждый «кадр» является отдельным набором данных?

Answer 1

«Стандарт» DICOM имеет так много различных опций, наряду с расширениями поставщиков, что большинство вещей возможно.

При этом большинство 3D-наборов данных DICOM, с которыми я столкнулся, представляют собой стеки 2D-изображений.Для последующей обработки, это зависит исключительно от машины обработки изображений.

Если вы ищете свободно доступную библиотеку DICOM, вы можете попробовать GDCM , я был ей очень доволен.

Answer 2

Исходный формат DICOM MR содержит одно двумерное изображение. Этот формат все еще широко поддерживается, вполне вероятно, что у вас есть. Если это равно тому, что у вас есть, то вы захотите собрать все изображения в серии, чтобы построить свой объем.

Более новый улучшенный формат изображения МР позволяет сохранять весь объем в виде многокадрового изображения. Если это так, это ваш объем. Я не помню, должен ли один расширенный объект MR быть целой серией или нет.

Вы можете различить их, посмотрев на атрибут DICOM UID класса SOP (0008,0016):

 Original MR:  1.2.840.10008.5.1.4.1.1.4   
 Enhanced MR:  1.2.840.10008.5.1.4.1.1.4.1

Выше, когда я сказал, что вам может потребоваться собрать «все изображения в серии» для создания тома, это означает, что вы используете изображения, имеющие одинаковое значение для атрибута UID экземпляра серии (0020,000E ).

Примечания:

• Пуристы DICOM предпочитают термин «определение объекта информации об изображении» вместо слова «формат», как я его использовал.
• Пуристы DICOM будут возражать, говоря, что UID класса SOP определяет формат изображения. Для ваших целей это будет работать.