Я не совсем уверен, что вы подразумеваете под "USB-to-COM".Вы имеете в виду, что USB-соединение доступно как последовательный порт RS232 на ПК (он же COM-порт в Windows)?
Если это так, вам следует обратиться к библиотеке RXTX здесь: http://rxtx.qbang.org.Он обеспечивает поддержку связи через последовательный порт Java на нескольких платформах.Если вы новичок в Java, вам может показаться, что программирование через последовательный порт не является самым простым способом изучения Java, но примеры, включенные в RXTX, должны быть понятны в противном случае.