Вы по-прежнему можете ссылаться на SMO из приложения .NET 4.0, даже если оно предназначено для платформы .NET 2.0.
Если вы получаете исключение Mixed mode assembly is built against version 'v2.0.50727' of the
runtime and cannot be loaded in the 4.0 runtime without additional
configuration information.
, установка последней версии SQL Server SDK (SQL Server 2008 R2) должна исправить это, даже если на компьютере установлена более старая версия SQL Server, например. 2005