Я довольно много работал над Zend_Db в версии 1.0 ZF, и я тоже немного использовал Doctrine.
Не должно быть никакого конфликта между Zend_Db и другим ORM. Однако объекты, извлеченные через интерфейс Zend_Db, не будут знать об объектах, извлеченных через другой интерфейс ORM, например, Учение и наоборот.
Так что, если ваш другой ORM попытался проявить смекалку в отношении пакетных фиксаций в базе данных, вы бы хотели заставить его фиксироваться перед попыткой загрузки данных из тех же строк в объекте Zend_Db. И аналогично в обратном порядке.
Тем не менее, ни в одной из библиотек ORM не было бы ничего, что помогло бы вам управлять этими делами, поэтому вы должны знать, как ведет себя каждый ORM. Похоже, вы настраиваете себя на большую работу, чтобы приспособиться к неплотным абстракциям , и вам лучше переписать существующий код Zend_Db.