Я видел ту же проблему на моем MacBook, используя стандартную сборку от MacPorts, но вариант no_x11 работал хорошо для меня. Я также использую универсальный вариант, потому что я использую библиотеку из 32-разрядного приложения, так вот как выглядела моя командная строка MacPorts:
sudo port install clutter +universal +no_x11
Возможно, вы можете опустить '+ universal', если вы хотите, чтобы библиотека была построена только для вашей архитектуры по умолчанию.