Вы не можете GZip напрямую всю папку, так как GZip работает с одним потоком данных. Сначала вам нужно превратить папку в такой поток.
Один из способов сделать это - создать Tar архив из каталога. Это даст вам один поток для работы, и, поскольку формат Tar не сжимается, GZip обычно обеспечивает хорошие коэффициенты сжатия для файлов Tar.