Определите это где-нибудь в конфигурационном файле.
Предполагается, что вы используете стиль MVC, где все маршрутизируется через один index.php, а затем
realpath('.');
Покажет вам путь к текущему рабочему каталогу (т.е. где index.php)
Итак, вы можете определить это как
define('PROJECT_ROOT', realpath('.'));
Если это не MVC и вам нужно, чтобы он работал с файлами в подпапках, вы можете просто жестко закодировать его в файле конфигурации
define('PROJECT_ROOT', 'C:/wamp/www/mysite');
Тогда при включении чего-то, что вы можете сделать;
include PROJECT_ROOT . '/path/to/include.php';