Вероятно, проблема с вашим PATH. Или попробуйте установить переменную среды AUTOM4TE на правильный autom4te при запуске aclocal:
env AUTOM4TE=/path/to/autom4te-2.67 aclocal
Однако, как правило, вообще не вызывается aclocal; вместо этого запустите autoreconf.