Вы можете сделать:
perl -i.bak -ne 'print unless(/[^[:ascii:]]/)' file
Regex объяснение для /[^[:ascii:]]/
:
/
начало регулярного выражения
[
начало класса персонажей
^
сделать это отрицательным классом символов (класс, который соответствует чему-либо кроме того, что перечислено)
[:ascii:]
любой символ ASCII
]
конец класса символов
/
конец регулярного выражения