Вы можете использовать jQuery, чтобы сделать это с чем-то вроде этих строк
function hideFrame()
{
$('#framename').slideUp(1000);
}
Тогда вы можете использовать функцию тайм-аута для вызова этого:
setTimeout('hideFrame()', 5000); // Change 5000 to whatever you like in milliseconds...
И не забудьте изменить '#framename 'к тому, что у вас называется, например:
<div id="framename">blah blah</div>
Надеюсь, это поможет.
(только что заметил, что вы поставили «не iframes» ...)