Я думаю, просто зафиксируйте только изменения. Если у вас есть свободное время, вы можете узнать больше о файлах (для чего они нужны) или сравнить их с предыдущей версией (если есть). Некоторые svn обычно выводят файлы при оформлении заказа.
Благодарю.