Чтобы установить включаемые каталоги, вы можете добавить их в переменную среды INCLUDE. Вы используете тот же формат, что и в PATH env. переменная - вы разделяете пути точкой с запятой.
Чтобы установить каталоги библиотеки - вы можете сделать это аналогичным образом, поместив их в переменную среды LIB.
Чтобы установить переменные среды, просто щелкните правой кнопкой мыши «Мой компьютер», выберите «Свойства». Затем вы переходите на вкладку «Дополнительно», и есть кнопка «Переменные среды».
Или вы можете запустить MSBuild из сценария BATCH, и в этом случае перед вызовом MSBuild вы можете установить переменные INCLUDE и LIB следующим образом:
set INCLUDE=C:\Libraries\LibA\Include
set LIB=C:\Libraries\LibA\Lib\x86