sql.el встроен в emacs и имеет два режима; Вы должны быть в состоянии работать с этим, чтобы отправлять команды mysql из elisp, но, похоже, это не делает очевидным то, как вы это делаете.
Я не уверен, что это работает полностью из elisp без взаимодействия с пользователем или в режиме sql. У него есть функции для отправки строки для выполнения.
Эта ссылка выглядит интересно; он отключает режим mysql и делает режим более похожим на то, как вы хотите, чтобы он работал.