Вам нужно будет открыть соответствующие представления Mylyn, которые представляют собой список задач и представления репозитория задач. Чтобы открыть вид, используйте Окно -> Показать вид. После открытия этих представлений добавьте хранилище задач в представлении хранилища задач, а затем добавьте запрос в представлении списка задач, который загрузит соответствующие задачи. Когда вы начнете работать над задачей, то есть, активировав эту задачу, вы заметите, что кнопка фокуса добавлена в несколько представлений, таких как проводник пакетов. Если вы нажмете кнопку фокуса, в этом представлении будут показаны только файлы, связанные с заданием.
В этом видео рассказывается о настройке: http://tasktop.com/videos/1.6/setup/tasklist/
В этом видео показано, как работать с задачами: http://tasktop.com/videos/1.6/setup/focus/