У меня была похожая проблема; Я решил это следующим образом:
- Выполнение обратного слияния для затронутых ревизий. Я просто посмотрел на журнал svn для конфликтующей папки и в обратном порядке объединил все ревизии. Это сообщение о конфликтах деревьев еще раз. Я принял единственную опцию: «Принять рабочую копию».
- Затем я снова выполнил слияние. О конфликтах деревьев не сообщалось.
Поздний ответ, но, возможно, все еще полезен для других пользователей.