Rational Team Concert, по своей сути, представляет собой просто набор веб-сервисов на основе REST. Каждое отдельное действие над рабочими элементами, исходным кодом, сборками или чем-либо - это всего лишь серия вызовов веб-службы. Прелесть в том, что вызов веб-службы не зависит от языка! Если вы зайдете на jazz.net, вы можете прочитать о том, как получить доступ к этим веб-сервисам и получить к ним доступ через Perl Не стесняйтесь задавать вопросы в jazz.net/forums
Конечно, интерфейсы командной строки также могут помочь! Проверьте scm и repotools.