Конечно, я использую
(set-background-color "gray10")
(set-foreground-color "wheat")
(set-cursor-color "wheat")
(set-mouse-color "wheat")
(set-face-background 'default "black")
(set-frame-font "Bitstream Vera Sans Mono-10") ;; you may not have that font
in ~/.emacs
(точнее источник файла из него). Эти цвета хорошо работают для многих языков программирования, в частности R, C / C ++, SQL, сценариев оболочки ... Вы, вероятно, можете адаптировать их по своему усмотрению (здесь R GUI).
См. Emacs Wiki для бесчисленных альтернатив.