В дополнение к использованию noconflict (), как предложил Crayon (что является хорошим ответом +1), вы также можете использовать jquery вместо $ для выполнения вызовов jquery.Так, например ... вместо ...
$(function() { ... });
вы бы сделали
jQuery(function() { ... });
Это позволит избежать любых конфликтов между другими библиотеками, которые используют $.