Если бы у команды del не было рекурсивного удаления флага / S, я бы использовал AWK, чтобы сделать что-то подобное (вам понадобятся инструменты UNIX для Windows):
dir MyProject\*.* /ad /s /b | gawk "{print \"del \\\"\" $0 \"\\*.type\\\"\";}" | cmd
Мои 2 цента, на случай, если вам когда-нибудь понадобится сделать что-то подобное (применить программу ко всем файлам типа X во всех подпапках) с помощью команды, в которой отсутствует рекурсивный флаг.