У меня была такая же проблема, и да, это потому, что инструмент не мог распознать путь. Я использовал неправильный слэш, потому что получил плохой совет из блога разработчика.
Пример строки команды, если файл «origin.apk» находится в папке с именем «storage» в каталоге C:
zipalign -f -v 4 “c:\storage\origin.apk” “c:\storage\done.apk”
Убедитесь, что вы используете косую черту над клавишей ввода ... во многих «примерах», которые я видел, используется клавиша Shift, и это не сработает. Это возьмет apk с именем «origin.apk» и zipalign его, а затем сохранит его в том же каталоге, что и файл «done.apk».
Может быть, это только на Vista, я не знаю. Я использую 32-битную Windows Vista.