Хотя я не знаком с SQL Server CE, я предполагаю, что MS предоставляет для него драйвер ODBC. Хотя это не рекомендуется для производственного использования, вы можете использовать мост JDBC-ODBC для установления соединения.
Class.forName("sun.jdbc.odbc.JdbcOdbcDriver");
Connection con = DriverManager.getConnection("jdbc:odbc:<yourODBC_DSN>");
Повторюсь, драйвер моста JDBC-ODBC, поставляемый с JDBC, рекомендуется только для разработки и тестирования или когда нет другой альтернативы.