Резервное копирование онлайн (Интернет) является важной частью процесса.
Все виды резервных копий на внешние диски обречены на провал, если они не сделаны назначенным персоналом (например, секретным). Если вы очень маленький магазин (или µ-ISV, такой как я), это не вариант. Даже тогда, где хранится внешний диск? Сейф с противопожарной защитой - единственный возможный хороший ответ. Хранить их вне офиса нехорошо: люди забудут принести их обратно в офис для периодического резервного копирования.
Резервное копирование на NAS является ИМХО лучшим решением, чем внешние накопители. Но в тот день, когда здание горит, резервные копии за пределами площадки - это ваш единственный шанс остаться в живых.
Я лично использую Mozy для резервного копирования основных локальных каталогов в дополнение к базе данных SCC.
Нет необходимости говорить, что шифрование AES-256 или аналогичное должно быть обязательным для хранения вашего исходного кода на чужих жестких дисках. Мозы и все его серьезные конкуренты предлагают его.